シンジの母「ユイ」が生存する新たな「学園エヴァ」登場！
第3新東京市で父ゲンドウ・母ユイと一緒に暮らすシンジ。幼馴染みのアスカと一緒に登校してはトウジ、ケンスケにからかわれる日々を送るシンジは、ある日帰宅すると、不思議な雰囲気を持つ少女レイと出会う――。
コミックス第１巻 第１話が無料！
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コミックス情報
新世紀エヴァンゲリオン 碇シンジ育成計画(18)
ゼーレは総力を上げ、実験中のレイに攻撃を仕掛ける。シンジ達の活躍でレイを救出するも、レイは記憶を失ってしまう。レイの記憶を取り戻すためシンジはレイに今までの思い出、そして自分の気持ちを伝えるのだった。
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新世紀エヴァンゲリオン 碇シンジ育成計画(17)
学芸会の出し物で「ロミオとジュリエット」をやることになったシンジたち。ジュリエット役はレイに、そしてロミオ役はアスカに決定！ 初めは男役に難色を示したもののシンジが脚本を書くということでしぶしぶ承諾するが……。
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新世紀エヴァンゲリオン 碇シンジ育成計画(16)
沈黙を破りゼーレが再びＭＡＧＩシステムへハッキングを仕掛ける。研究所では現場指揮を任されたユイがシンジ達に迎撃に向かわせる。しかし敵の攻撃を受けたシンジがその場から消えてしまい窮地に陥るのだが!?
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新世紀エヴァンゲリオン 碇シンジ育成計画(15)
ミサトの頼みで廊下掃除をすることになったシンジ。偶然居合わせたレイに手伝ってもらえることになり、レイが水汲みに行くのだが!? シンジとレイの距離が少しだけ縮む「学園エヴァ」15巻!!
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新世紀エヴァンゲリオン 碇シンジ育成計画(14)
キョウコの友人のはからいで、喫茶店で一日手伝うことになったシンジ・アスカ・キョウコの3人。もちろんキョウコは役にたたず、シンジとアスカで注文を処理するもののトラブル続きでもう大変!?
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新世紀エヴァンゲリオン 碇シンジ育成計画(13)
度重なる侵攻の失敗でついにゼーレは本格的な攻撃を始める。これに対抗するためゲンドウは人工進化研究所を要塞化する。そして赤木博士を中心にユイ・キョウコで仮想空間でのシンジ達の強化を図るのだった！
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新世紀エヴァンゲリオン 碇シンジ育成計画(12)
再びゼーレの攻撃が始まり、仮想空間に出撃したシンジ達。しかし、敵の強力な反撃を受け撤退を余儀なくされる。そこでゲンドウは単身敵に挑みシンジ達の出撃の時間を稼ぐ。新たな武器を携えシンジ達は再び出撃する！
